Il nucleo fondante dell’attuale I.C. “Enrico Pestalozzi” è costituito dalla Scuola Secondaria di I grado, nata alla fine degli anni sessanta del secolo precedente.
Nell’anno scolastico 2000/01 la scuola diviene Istituto Comprensivo, composto, fino all’anno 2011/2012, di 2 plessi di Scuola Secondaria di I grado, 2 plessi di Scuola Primaria e 2 plessi di Scuola dell’Infanzia.
I vari plessi, pur insistendo tutti a Torvaianica, erano tra loro distanti.
In seguito al Piano di Dimensionamento Scolastico (2012/2013) la scuola si è sdoppiata in 2 diversi Istituti Comprensivi: la sede centrale di Scuola Secondaria di I grado ha incorporato il limitrofo Circolo Didattico “Don Milani” che è interamente confluito con 2 plessi di Scuola Primaria e 3 plessi di Scuola dell’Infanzia, per costituire un diverso Istituto Comprensivo che ha conservato nome e struttura giuridica.
Il provvedimento di dimensionamento ha realizzato la naturale vocazione di unire due Istituti limitrofi e ha consentito di progettare in continuità rispetto al territorio, al curricolo e all’organizzazione.